Die originale Festungsanlage wurde 1365 als der Verwaltungs- und Regierungssitz von Nangchen Pahagpa Pael erbaut, der vom Kaiser der Yuan-Dynastie zum Gouverneur des Nancheng Bezirks ernannt wurde.
Im Juni 1904 wurde der Dzong von Gyantse als Verteidigungsanlage gegen den britischen Angriff teilweise zerstört. Während der Kulturrevolution wurde der Dzong zur Ruine, und wird seither jedoch restauriert.
Heute sieht man im Dzong von Gyantse die Versammlungshalle, die Ausstellungshalle zum „Krieg gegen die Engländer" von 1904 sowie die obere und untere Kapelle des Klosters Sampal Norbuling.
Von Dzong bietet es sich ein fantastischer Blick über die Stadt Gyantse mit dem Tal.